Protein–RNA interactions for Protein: Q16515

ASIC2, Acid-sensing ion channel 2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC2Q16515 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ASIC2Q16515 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms