Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms