Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
USF2Q15853 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
USF2Q15853 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
USF2Q15853 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
USF2Q15853 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC1.51□□□□□ -2.17
USF2Q15853 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC1.51□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC1.51□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
USF2Q15853 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
USF2Q15853 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
USF2Q15853 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
USF2Q15853 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
USF2Q15853 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
USF2Q15853 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
USF2Q15853 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
USF2Q15853 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
USF2Q15853 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
USF2Q15853 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
USF2Q15853 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
USF2Q15853 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
USF2Q15853 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
USF2Q15853 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
USF2Q15853 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
USF2Q15853 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
USF2Q15853 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC1.5□□□□□ -2.17
USF2Q15853 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
USF2Q15853 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
USF2Q15853 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
USF2Q15853 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
USF2Q15853 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
USF2Q15853 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
USF2Q15853 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
USF2Q15853 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
USF2Q15853 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
USF2Q15853 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
USF2Q15853 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
USF2Q15853 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
USF2Q15853 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
USF2Q15853 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
USF2Q15853 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
USF2Q15853 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
USF2Q15853 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
USF2Q15853 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
USF2Q15853 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
USF2Q15853 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
USF2Q15853 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
USF2Q15853 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
USF2Q15853 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
USF2Q15853 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
USF2Q15853 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
USF2Q15853 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
USF2Q15853 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
USF2Q15853 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
USF2Q15853 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
USF2Q15853 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
USF2Q15853 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
USF2Q15853 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
USF2Q15853 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
USF2Q15853 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
USF2Q15853 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
USF2Q15853 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
USF2Q15853 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
USF2Q15853 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
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