Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC0.8□□□□□ -2.28
NEDD8Q15843 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
NEDD8Q15843 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
NEDD8Q15843 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
NEDD8Q15843 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
NEDD8Q15843 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
NEDD8Q15843 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
NEDD8Q15843 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
NEDD8Q15843 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
NEDD8Q15843 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
NEDD8Q15843 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
NEDD8Q15843 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
NEDD8Q15843 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
NEDD8Q15843 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC0.8□□□□□ -2.28
NEDD8Q15843 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
NEDD8Q15843 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
NEDD8Q15843 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
NEDD8Q15843 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
NEDD8Q15843 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
NEDD8Q15843 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
NEDD8Q15843 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC0.8□□□□□ -2.28
NEDD8Q15843 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
NEDD8Q15843 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
NEDD8Q15843 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
NEDD8Q15843 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
NEDD8Q15843 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
NEDD8Q15843 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
NEDD8Q15843 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
NEDD8Q15843 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
NEDD8Q15843 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
NEDD8Q15843 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
NEDD8Q15843 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
NEDD8Q15843 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC0.79□□□□□ -2.28
NEDD8Q15843 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
NEDD8Q15843 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC0.79□□□□□ -2.28
NEDD8Q15843 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
NEDD8Q15843 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
NEDD8Q15843 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
NEDD8Q15843 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
NEDD8Q15843 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
NEDD8Q15843 ETFRF1-202ENST00000553788 708 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
NEDD8Q15843 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
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NEDD8Q15843 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
NEDD8Q15843 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
NEDD8Q15843 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
NEDD8Q15843 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
NEDD8Q15843 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
NEDD8Q15843 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
NEDD8Q15843 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
NEDD8Q15843 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
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NEDD8Q15843 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
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NEDD8Q15843 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
NEDD8Q15843 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
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NEDD8Q15843 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
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NEDD8Q15843 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
NEDD8Q15843 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
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NEDD8Q15843 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC0.77□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC0.77□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
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