Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC0.99□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ALX1Q15699 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ALX1Q15699 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ALX1Q15699 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
ALX1Q15699 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ALX1Q15699 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
ALX1Q15699 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
ALX1Q15699 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ALX1Q15699 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ALX1Q15699 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ALX1Q15699 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
ALX1Q15699 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
ALX1Q15699 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
ALX1Q15699 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ALX1Q15699 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ALX1Q15699 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ALX1Q15699 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ALX1Q15699 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ALX1Q15699 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ALX1Q15699 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ALX1Q15699 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ALX1Q15699 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ALX1Q15699 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.5 ms