Protein–RNA interactions for Protein: Q15436

SEC23A, Protein transport protein Sec23A, humanhuman

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23AQ15436 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SEC23AQ15436 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
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