Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TTF1Q15361 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TTF1Q15361 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
TTF1Q15361 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TTF1Q15361 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TTF1Q15361 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TTF1Q15361 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
TTF1Q15361 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TTF1Q15361 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TTF1Q15361 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
TTF1Q15361 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
TTF1Q15361 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
TTF1Q15361 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TTF1Q15361 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TTF1Q15361 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TTF1Q15361 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TTF1Q15361 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TTF1Q15361 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TTF1Q15361 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TTF1Q15361 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TTF1Q15361 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TTF1Q15361 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TTF1Q15361 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TTF1Q15361 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TTF1Q15361 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TTF1Q15361 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TTF1Q15361 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TTF1Q15361 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TTF1Q15361 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TTF1Q15361 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TTF1Q15361 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TTF1Q15361 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TTF1Q15361 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TTF1Q15361 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TTF1Q15361 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TTF1Q15361 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TTF1Q15361 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TTF1Q15361 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TTF1Q15361 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TTF1Q15361 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TTF1Q15361 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TTF1Q15361 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TTF1Q15361 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TTF1Q15361 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TTF1Q15361 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TTF1Q15361 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
TTF1Q15361 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
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TTF1Q15361 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
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TTF1Q15361 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
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TTF1Q15361 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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TTF1Q15361 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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TTF1Q15361 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TTF1Q15361 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TTF1Q15361 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TTF1Q15361 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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TTF1Q15361 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TTF1Q15361 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
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TTF1Q15361 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
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TTF1Q15361 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
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TTF1Q15361 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TTF1Q15361 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
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TTF1Q15361 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TTF1Q15361 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TTF1Q15361 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TTF1Q15361 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TTF1Q15361 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TTF1Q15361 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TTF1Q15361 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TTF1Q15361 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TTF1Q15361 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TTF1Q15361 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TTF1Q15361 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TTF1Q15361 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TTF1Q15361 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
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