Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
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