Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PCOLCEQ15113 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.2 ms