Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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