Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC0.74□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC0.74□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC0.74□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC0.74□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC0.73□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC0.72□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.72□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC0.72□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC0.72□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC0.72□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
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