Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SMC1AQ14683 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SMC1AQ14683 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SMC1AQ14683 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SMC1AQ14683 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SMC1AQ14683 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SMC1AQ14683 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SMC1AQ14683 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SMC1AQ14683 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SMC1AQ14683 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SMC1AQ14683 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SMC1AQ14683 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SMC1AQ14683 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SMC1AQ14683 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SMC1AQ14683 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SMC1AQ14683 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SMC1AQ14683 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SMC1AQ14683 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SMC1AQ14683 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SMC1AQ14683 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SMC1AQ14683 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SMC1AQ14683 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
SMC1AQ14683 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SMC1AQ14683 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SMC1AQ14683 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SMC1AQ14683 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
SMC1AQ14683 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SMC1AQ14683 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SMC1AQ14683 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
SMC1AQ14683 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SMC1AQ14683 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SMC1AQ14683 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
SMC1AQ14683 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SMC1AQ14683 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SMC1AQ14683 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SMC1AQ14683 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SMC1AQ14683 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SMC1AQ14683 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SMC1AQ14683 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SMC1AQ14683 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SMC1AQ14683 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SMC1AQ14683 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SMC1AQ14683 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SMC1AQ14683 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SMC1AQ14683 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SMC1AQ14683 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SMC1AQ14683 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SMC1AQ14683 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SMC1AQ14683 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SMC1AQ14683 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SMC1AQ14683 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SMC1AQ14683 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SMC1AQ14683 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SMC1AQ14683 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SMC1AQ14683 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SMC1AQ14683 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SMC1AQ14683 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SMC1AQ14683 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SMC1AQ14683 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SMC1AQ14683 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SMC1AQ14683 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMC1AQ14683 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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