Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC2□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC2□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC2□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC2□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC2□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC2□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC2□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC2□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC2□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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DDX39BQ13838 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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DDX39BQ13838 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
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DDX39BQ13838 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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