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| FHL3 | Q13643 | ACA59.1-201 | ENST00000515966 | 143 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
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| FHL3 | Q13643 | RPL23AP49-201 | ENST00000492925 | 468 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
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| FHL3 | Q13643 | AC105999.1-201 | ENST00000518722 | 473 nt | TSL 3 BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC023906.2-201 | ENST00000558343 | 462 nt | TSL 3 BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
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| FHL3 | Q13643 | AC080078.3-201 | ENST00000605407 | 463 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| FHL3 | Q13643 | SMCR2_2.1-201 | ENST00000619783 | 161 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
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| FHL3 | Q13643 | AL359757.2-201 | ENST00000624309 | 274 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| FHL3 | Q13643 | LMBRD1-201 | ENST00000370570 | 2099 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| FHL3 | Q13643 | KCNJ16-209 | ENST00000589377 | 3684 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| FHL3 | Q13643 | HAUS6P2-201 | ENST00000433254 | 2404 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| FHL3 | Q13643 | TUG1-202 | ENST00000521091 | 2110 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| FHL3 | Q13643 | TENM1-201 | ENST00000371130 | 12875 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| FHL3 | Q13643 | IFT80-220 | ENST00000483465 | 4044 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| FHL3 | Q13643 | R3HDM1-220 | ENST00000628915 | 4325 nt | TSL 5 BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| FHL3 | Q13643 | SEC31A-203 | ENST00000348405 | 4012 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| FHL3 | Q13643 | Y_RNA.28-201 | ENST00000362554 | 111 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| FHL3 | Q13643 | RNU6-78P-201 | ENST00000362897 | 107 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| FHL3 | Q13643 | Y_RNA.187-201 | ENST00000363918 | 113 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| FHL3 | Q13643 | RNU1-100P-201 | ENST00000365255 | 165 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
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| FHL3 | Q13643 | RNU6-308P-201 | ENST00000390957 | 107 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| FHL3 | Q13643 | RNY4P36-201 | ENST00000391116 | 96 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
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| FHL3 | Q13643 | AL358472.1-201 | ENST00000431295 | 329 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC090617.2-201 | ENST00000433167 | 404 nt | TSL 3 BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| FHL3 | Q13643 | AL138900.1-201 | ENST00000449345 | 399 nt | TSL 3 BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC046130.2-201 | ENST00000537655 | 794 nt | TSL 3 BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC005476.1-201 | ENST00000554427 | 397 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC020891.1-201 | ENST00000558785 | 174 nt | TSL 3 BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC025281.1-201 | ENST00000567026 | 265 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| FHL3 | Q13643 | CYP4A43P-201 | ENST00000568156 | 121 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| FHL3 | Q13643 | RN7SL703P-201 | ENST00000578485 | 302 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| FHL3 | Q13643 | CPDP1-201 | ENST00000579660 | 283 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC087749.2-201 | ENST00000583910 | 352 nt | TSL 5 BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| FHL3 | Q13643 | HMGN2P15-201 | ENST00000585707 | 270 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| FHL3 | Q13643 | BNIP3P16-201 | ENST00000589779 | 534 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| FHL3 | Q13643 | AL356157.2-201 | ENST00000605122 | 111 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| FHL3 | Q13643 | LINC02112-205 | ENST00000606744 | 236 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| FHL3 | Q13643 | MAP3K21-201 | ENST00000366622 | 4005 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| FHL3 | Q13643 | AL161912.2-201 | ENST00000565707 | 3007 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| FHL3 | Q13643 | PTCD2-202 | ENST00000380639 | 11151 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| FHL3 | Q13643 | LINC00890-202 | ENST00000569275 | 4595 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| FHL3 | Q13643 | MBNL1-211 | ENST00000463374 | 5092 nt | APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| FHL3 | Q13643 | PTGFR-203 | ENST00000370758 | 4337 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |