Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC1.18□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC1.18□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
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TCOF1Q13428 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC1.17□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
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TCOF1Q13428 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
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TCOF1Q13428 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
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TCOF1Q13428 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC1.16□□□□□ -2.22
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TCOF1Q13428 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
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TCOF1Q13428 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
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