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| PTK7 | Q13308 | DEFB130B-201 | ENST00000437818 | 240 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.9 | □□□□□ -1.63 | | |
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| PTK7 | Q13308 | CD80-201 | ENST00000264246 | 2725 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.88 | □□□□□ -1.63 | | |
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| PTK7 | Q13308 | AC137590.2-201 | ENST00000619709 | 240 nt | BASIC | 4.88 | □□□□□ -1.63 | | |
| PTK7 | Q13308 | MAPK10-235 | ENST00000638225 | 8941 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 4.88 | □□□□□ -1.63 | | |
| PTK7 | Q13308 | TEX9-207 | ENST00000560582 | 2005 nt | TSL 3 BASIC | 4.88 | □□□□□ -1.63 | | |
| PTK7 | Q13308 | ANKRD34C-201 | ENST00000421388 | 4951 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.88 | □□□□□ -1.63 | | |
| PTK7 | Q13308 | PIK3CB-214 | ENST00000544716 | 3181 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.88 | □□□□□ -1.63 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC068254.2-201 | ENST00000623938 | 3577 nt | BASIC | 4.88 | □□□□□ -1.63 | | |
| PTK7 | Q13308 | HSPA8P1-201 | ENST00000425843 | 1833 nt | BASIC | 4.88 | □□□□□ -1.63 | | |
| PTK7 | Q13308 | KLHL13-208 | ENST00000541812 | 3102 nt | TSL 2 BASIC | 4.88 | □□□□□ -1.63 | | |
| PTK7 | Q13308 | FAM133A-202 | ENST00000332647 | 3159 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 4.88 | □□□□□ -1.63 | | |
| PTK7 | Q13308 | PCDH15-211 | ENST00000395440 | 3177 nt | TSL 5 BASIC | 4.88 | □□□□□ -1.63 | | |
| PTK7 | Q13308 | CEP97-201 | ENST00000341893 | 8361 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 4.87 | □□□□□ -1.63 | | |
| PTK7 | Q13308 | SHOC2-201 | ENST00000265277 | 3691 nt | TSL 2 BASIC | 4.87 | □□□□□ -1.63 | | |
| PTK7 | Q13308 | LRRC9-202 | ENST00000445360 | 4717 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.87 | □□□□□ -1.63 | | |
| PTK7 | Q13308 | AMY2A-201 | ENST00000414303 | 1634 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.87 | □□□□□ -1.63 | | |
| PTK7 | Q13308 | LINC01355-201 | ENST00000566551 | 5444 nt | BASIC | 4.87 | □□□□□ -1.63 | | |
| PTK7 | Q13308 | ZGRF1-212 | ENST00000612287 | 2176 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.87 | □□□□□ -1.63 | | |
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| PTK7 | Q13308 | RNU6-280P-201 | ENST00000364145 | 104 nt | BASIC | 4.87 | □□□□□ -1.63 | | |
| PTK7 | Q13308 | RN7SKP280-201 | ENST00000364196 | 304 nt | BASIC | 4.87 | □□□□□ -1.63 | | |
| PTK7 | Q13308 | SNORD116-20-201 | ENST00000384529 | 92 nt | BASIC | 4.87 | □□□□□ -1.63 | | |
| PTK7 | Q13308 | SNORD96B-201 | ENST00000386148 | 79 nt | BASIC | 4.87 | □□□□□ -1.63 | | |