Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
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