Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SRSF5Q13243 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SRSF5Q13243 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SRSF5Q13243 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SRSF5Q13243 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SRSF5Q13243 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SRSF5Q13243 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SRSF5Q13243 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SRSF5Q13243 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SRSF5Q13243 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SRSF5Q13243 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SRSF5Q13243 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SRSF5Q13243 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SRSF5Q13243 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SRSF5Q13243 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SRSF5Q13243 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SRSF5Q13243 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SRSF5Q13243 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SRSF5Q13243 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SRSF5Q13243 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SRSF5Q13243 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SRSF5Q13243 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SRSF5Q13243 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SRSF5Q13243 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SRSF5Q13243 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SRSF5Q13243 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SRSF5Q13243 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SRSF5Q13243 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SRSF5Q13243 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SRSF5Q13243 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SRSF5Q13243 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SRSF5Q13243 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SRSF5Q13243 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SRSF5Q13243 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SRSF5Q13243 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SRSF5Q13243 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SRSF5Q13243 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SRSF5Q13243 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SRSF5Q13243 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SRSF5Q13243 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SRSF5Q13243 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SRSF5Q13243 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
SRSF5Q13243 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SRSF5Q13243 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SRSF5Q13243 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SRSF5Q13243 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SRSF5Q13243 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SRSF5Q13243 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SRSF5Q13243 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SRSF5Q13243 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SRSF5Q13243 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SRSF5Q13243 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SRSF5Q13243 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SRSF5Q13243 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SRSF5Q13243 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SRSF5Q13243 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SRSF5Q13243 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SRSF5Q13243 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SRSF5Q13243 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SRSF5Q13243 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SRSF5Q13243 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SRSF5Q13243 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SRSF5Q13243 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SRSF5Q13243 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SRSF5Q13243 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SRSF5Q13243 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SRSF5Q13243 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SRSF5Q13243 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SRSF5Q13243 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SRSF5Q13243 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
SRSF5Q13243 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SRSF5Q13243 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SRSF5Q13243 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.3 ms