Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
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