Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
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TRAF3Q13114 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
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TRAF3Q13114 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
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TRAF3Q13114 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
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TRAF3Q13114 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
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TRAF3Q13114 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
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TRAF3Q13114 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC3□□□□□ -1.93
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TRAF3Q13114 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC3□□□□□ -1.93
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TRAF3Q13114 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
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TRAF3Q13114 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC3□□□□□ -1.93
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