Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
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