Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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BNIP1Q12981 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
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BNIP1Q12981 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
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BNIP1Q12981 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
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