Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SMARCB1Q12824 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMARCB1Q12824 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMARCB1Q12824 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMARCB1Q12824 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMARCB1Q12824 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMARCB1Q12824 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMARCB1Q12824 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMARCB1Q12824 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMARCB1Q12824 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMARCB1Q12824 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMARCB1Q12824 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SMARCB1Q12824 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMARCB1Q12824 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
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SMARCB1Q12824 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMARCB1Q12824 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMARCB1Q12824 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMARCB1Q12824 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMARCB1Q12824 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMARCB1Q12824 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMARCB1Q12824 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMARCB1Q12824 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SMARCB1Q12824 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMARCB1Q12824 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SMARCB1Q12824 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMARCB1Q12824 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMARCB1Q12824 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SMARCB1Q12824 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMARCB1Q12824 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
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SMARCB1Q12824 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMARCB1Q12824 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SMARCB1Q12824 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SMARCB1Q12824 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SMARCB1Q12824 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMARCB1Q12824 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SMARCB1Q12824 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMARCB1Q12824 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
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SMARCB1Q12824 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
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SMARCB1Q12824 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SMARCB1Q12824 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMARCB1Q12824 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMARCB1Q12824 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
SMARCB1Q12824 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
SMARCB1Q12824 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SMARCB1Q12824 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SMARCB1Q12824 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SMARCB1Q12824 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
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SMARCB1Q12824 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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SMARCB1Q12824 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SMARCB1Q12824 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SMARCB1Q12824 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SMARCB1Q12824 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SMARCB1Q12824 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SMARCB1Q12824 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SMARCB1Q12824 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SMARCB1Q12824 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
SMARCB1Q12824 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SMARCB1Q12824 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMARCB1Q12824 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SMARCB1Q12824 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMARCB1Q12824 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMARCB1Q12824 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMARCB1Q12824 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SMARCB1Q12824 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SMARCB1Q12824 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMARCB1Q12824 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SMARCB1Q12824 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SMARCB1Q12824 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMARCB1Q12824 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMARCB1Q12824 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMARCB1Q12824 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMARCB1Q12824 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SMARCB1Q12824 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMARCB1Q12824 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SMARCB1Q12824 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMARCB1Q12824 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMARCB1Q12824 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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