Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NUP160Q12769 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NUP160Q12769 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NUP160Q12769 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NUP160Q12769 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NUP160Q12769 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NUP160Q12769 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NUP160Q12769 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NUP160Q12769 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NUP160Q12769 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NUP160Q12769 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NUP160Q12769 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
NUP160Q12769 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
NUP160Q12769 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
NUP160Q12769 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
NUP160Q12769 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NUP160Q12769 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NUP160Q12769 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
NUP160Q12769 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NUP160Q12769 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NUP160Q12769 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NUP160Q12769 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
NUP160Q12769 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NUP160Q12769 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NUP160Q12769 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NUP160Q12769 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NUP160Q12769 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.51□□□□□ -2.17
NUP160Q12769 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NUP160Q12769 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NUP160Q12769 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NUP160Q12769 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NUP160Q12769 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NUP160Q12769 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms