Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
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PTPRBP23467 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
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PTPRBP23467 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
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PTPRBP23467 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
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PTPRBP23467 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
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PTPRBP23467 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
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