Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PITX3O75364 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
PITX3O75364 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
PITX3O75364 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PITX3O75364 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PITX3O75364 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PITX3O75364 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
PITX3O75364 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PITX3O75364 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
PITX3O75364 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
PITX3O75364 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
PITX3O75364 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PITX3O75364 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PITX3O75364 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PITX3O75364 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PITX3O75364 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PITX3O75364 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PITX3O75364 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PITX3O75364 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PITX3O75364 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PITX3O75364 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PITX3O75364 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PITX3O75364 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PITX3O75364 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PITX3O75364 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PITX3O75364 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
PITX3O75364 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
PITX3O75364 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PITX3O75364 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PITX3O75364 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PITX3O75364 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
PITX3O75364 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
PITX3O75364 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC0.71□□□□□ -2.3
PITX3O75364 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PITX3O75364 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PITX3O75364 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
PITX3O75364 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PITX3O75364 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PITX3O75364 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PITX3O75364 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
PITX3O75364 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.7□□□□□ -2.3
PITX3O75364 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PITX3O75364 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PITX3O75364 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PITX3O75364 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.7□□□□□ -2.3
PITX3O75364 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
PITX3O75364 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PITX3O75364 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PITX3O75364 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PITX3O75364 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
PITX3O75364 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
PITX3O75364 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PITX3O75364 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PITX3O75364 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PITX3O75364 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC0.7□□□□□ -2.3
PITX3O75364 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
PITX3O75364 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PITX3O75364 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
PITX3O75364 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PITX3O75364 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PITX3O75364 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
PITX3O75364 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
PITX3O75364 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PITX3O75364 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC0.7□□□□□ -2.3
PITX3O75364 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
PITX3O75364 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.7□□□□□ -2.3
PITX3O75364 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
PITX3O75364 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PITX3O75364 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
PITX3O75364 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC0.69□□□□□ -2.3
PITX3O75364 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PITX3O75364 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PITX3O75364 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PITX3O75364 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
PITX3O75364 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PITX3O75364 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PITX3O75364 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
PITX3O75364 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PITX3O75364 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
PITX3O75364 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PITX3O75364 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PITX3O75364 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PITX3O75364 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PITX3O75364 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PITX3O75364 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PITX3O75364 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC0.69□□□□□ -2.3
PITX3O75364 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PITX3O75364 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PITX3O75364 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PITX3O75364 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PITX3O75364 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
PITX3O75364 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.69□□□□□ -2.3
PITX3O75364 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
PITX3O75364 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
PITX3O75364 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PITX3O75364 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PITX3O75364 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PITX3O75364 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PITX3O75364 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
PITX3O75364 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.2 ms