Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
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