Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
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