Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.5 ms