Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF548Q8NEK5 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF548Q8NEK5 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF548Q8NEK5 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF548Q8NEK5 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF548Q8NEK5 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF548Q8NEK5 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF548Q8NEK5 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF548Q8NEK5 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF548Q8NEK5 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF548Q8NEK5 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF548Q8NEK5 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF548Q8NEK5 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF548Q8NEK5 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF548Q8NEK5 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF548Q8NEK5 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF548Q8NEK5 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF548Q8NEK5 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF548Q8NEK5 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF548Q8NEK5 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF548Q8NEK5 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF548Q8NEK5 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF548Q8NEK5 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF548Q8NEK5 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF548Q8NEK5 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF548Q8NEK5 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF548Q8NEK5 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF548Q8NEK5 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF548Q8NEK5 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF548Q8NEK5 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF548Q8NEK5 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF548Q8NEK5 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF548Q8NEK5 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF548Q8NEK5 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF548Q8NEK5 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF548Q8NEK5 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF548Q8NEK5 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF548Q8NEK5 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF548Q8NEK5 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF548Q8NEK5 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF548Q8NEK5 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF548Q8NEK5 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF548Q8NEK5 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF548Q8NEK5 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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ZNF548Q8NEK5 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF548Q8NEK5 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF548Q8NEK5 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF548Q8NEK5 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF548Q8NEK5 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF548Q8NEK5 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF548Q8NEK5 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF548Q8NEK5 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF548Q8NEK5 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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ZNF548Q8NEK5 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF548Q8NEK5 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF548Q8NEK5 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF548Q8NEK5 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF548Q8NEK5 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF548Q8NEK5 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF548Q8NEK5 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF548Q8NEK5 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF548Q8NEK5 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF548Q8NEK5 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF548Q8NEK5 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF548Q8NEK5 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
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ZNF548Q8NEK5 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
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ZNF548Q8NEK5 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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