Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
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