Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
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CCDC142Q17RM4 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
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CCDC142Q17RM4 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
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CCDC142Q17RM4 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
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CCDC142Q17RM4 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
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CCDC142Q17RM4 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
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CCDC142Q17RM4 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
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CCDC142Q17RM4 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
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CCDC142Q17RM4 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
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CCDC142Q17RM4 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
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CCDC142Q17RM4 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
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CCDC142Q17RM4 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
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CCDC142Q17RM4 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
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CCDC142Q17RM4 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
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