Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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RTN1Q16799 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
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RTN1Q16799 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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RTN1Q16799 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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RTN1Q16799 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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RTN1Q16799 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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RTN1Q16799 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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RTN1Q16799 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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RTN1Q16799 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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RTN1Q16799 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
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