Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC2.1□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.09□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
NRF1Q16656 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
NRF1Q16656 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
NRF1Q16656 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NRF1Q16656 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
NRF1Q16656 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
NRF1Q16656 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NRF1Q16656 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NRF1Q16656 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
NRF1Q16656 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NRF1Q16656 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
NRF1Q16656 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NRF1Q16656 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NRF1Q16656 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
NRF1Q16656 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NRF1Q16656 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
NRF1Q16656 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
NRF1Q16656 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NRF1Q16656 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NRF1Q16656 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NRF1Q16656 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NRF1Q16656 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NRF1Q16656 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
NRF1Q16656 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
NRF1Q16656 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NRF1Q16656 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NRF1Q16656 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
NRF1Q16656 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
NRF1Q16656 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
NRF1Q16656 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
NRF1Q16656 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
NRF1Q16656 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NRF1Q16656 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
NRF1Q16656 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NRF1Q16656 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.9 ms