Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
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ECM1Q16610 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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ECM1Q16610 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
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ECM1Q16610 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
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ECM1Q16610 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
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ECM1Q16610 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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ECM1Q16610 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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ECM1Q16610 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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ECM1Q16610 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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