Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
FXNQ16595 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
FXNQ16595 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
FXNQ16595 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
FXNQ16595 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FXNQ16595 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FXNQ16595 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FXNQ16595 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FXNQ16595 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FXNQ16595 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FXNQ16595 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FXNQ16595 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FXNQ16595 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FXNQ16595 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
FXNQ16595 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
FXNQ16595 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
FXNQ16595 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FXNQ16595 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FXNQ16595 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
FXNQ16595 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FXNQ16595 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FXNQ16595 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FXNQ16595 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FXNQ16595 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FXNQ16595 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FXNQ16595 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FXNQ16595 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
FXNQ16595 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
FXNQ16595 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
FXNQ16595 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
FXNQ16595 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
FXNQ16595 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FXNQ16595 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FXNQ16595 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
FXNQ16595 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FXNQ16595 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FXNQ16595 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
FXNQ16595 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FXNQ16595 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FXNQ16595 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FXNQ16595 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FXNQ16595 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FXNQ16595 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FXNQ16595 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FXNQ16595 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FXNQ16595 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FXNQ16595 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
FXNQ16595 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FXNQ16595 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FXNQ16595 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
FXNQ16595 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FXNQ16595 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
FXNQ16595 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
FXNQ16595 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FXNQ16595 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FXNQ16595 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
FXNQ16595 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
FXNQ16595 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
FXNQ16595 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
FXNQ16595 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FXNQ16595 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
FXNQ16595 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.77
FXNQ16595 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.77
FXNQ16595 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
FXNQ16595 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
FXNQ16595 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
FXNQ16595 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FXNQ16595 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FXNQ16595 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FXNQ16595 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FXNQ16595 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FXNQ16595 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FXNQ16595 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
FXNQ16595 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FXNQ16595 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FXNQ16595 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FXNQ16595 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FXNQ16595 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FXNQ16595 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
FXNQ16595 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
FXNQ16595 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
FXNQ16595 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FXNQ16595 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FXNQ16595 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FXNQ16595 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FXNQ16595 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
FXNQ16595 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
FXNQ16595 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FXNQ16595 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FXNQ16595 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FXNQ16595 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
FXNQ16595 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
FXNQ16595 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
FXNQ16595 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
FXNQ16595 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
FXNQ16595 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
FXNQ16595 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
FXNQ16595 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
FXNQ16595 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
FXNQ16595 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
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