Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
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SSX1Q16384 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
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SSX1Q16384 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
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SSX1Q16384 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
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