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| SEMA3A | Q14563 | MIR559-201 | ENST00000385188 | 96 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | TRAV39-201 | ENST00000390466 | 331 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-903P-201 | ENST00000391270 | 109 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RPL5P18-201 | ENST00000406671 | 891 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-193P-201 | ENST00000410977 | 107 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RPS12P24-201 | ENST00000412619 | 387 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC080125.1-201 | ENST00000414888 | 684 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RPL31P12-201 | ENST00000422587 | 358 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | GTF2IP13-201 | ENST00000438487 | 386 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC004691.1-201 | ENST00000440376 | 547 nt | TSL 3 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | PRPS1P1-201 | ENST00000445305 | 876 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC007547.1-201 | ENST00000462177 | 490 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC010401.1-201 | ENST00000463867 | 348 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RPL23AP67-201 | ENST00000465341 | 474 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
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| SEMA3A | Q14563 | SNORA31.3-201 | ENST00000516029 | 96 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-1088P-201 | ENST00000516850 | 104 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | Y_RNA.711-201 | ENST00000516993 | 102 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
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| SEMA3A | Q14563 | AC087439.1-201 | ENST00000517920 | 398 nt | TSL 3 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
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| SEMA3A | Q14563 | AC011602.1-201 | ENST00000546484 | 331 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL132780.1-202 | ENST00000548322 | 591 nt | TSL 4 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
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| SEMA3A | Q14563 | AC008739.1-201 | ENST00000598137 | 575 nt | TSL 2 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL589765.7-201 | ENST00000601684 | 629 nt | TSL 3 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
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| SEMA3A | Q14563 | AC124303.1-201 | ENST00000605703 | 360 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC008121.3-201 | ENST00000618726 | 433 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC007405.1-203 | ENST00000623667 | 932 nt | TSL 5 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | TTK-211 | ENST00000627129 | 240 nt | TSL 5 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | HERC5-203 | ENST00000508159 | 2243 nt | TSL 2 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | CCDC82-202 | ENST00000423339 | 1878 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MIPOL1-206 | ENST00000545536 | 2073 nt | TSL 5 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | TMPRSS11A-202 | ENST00000508048 | 3247 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | EBAG9-210 | ENST00000620557 | 2186 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | WRN-201 | ENST00000298139 | 5215 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | TPTE2P4-201 | ENST00000258589 | 1605 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | LUZP2-208 | ENST00000620308 | 4981 nt | TSL 5 BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | UBE2L2-201 | ENST00000254302 | 429 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | Y_RNA.128-201 | ENST00000363391 | 112 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | Y_RNA.339-201 | ENST00000365325 | 102 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | CD24P4-201 | ENST00000382840 | 243 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-574P-201 | ENST00000384265 | 107 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MIR490-201 | ENST00000384865 | 128 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RN7SKP111-201 | ENST00000410349 | 271 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC009161.1-201 | ENST00000417306 | 376 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AP003025.1-201 | ENST00000421650 | 149 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC007919.1-201 | ENST00000429380 | 217 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | HMGN2P31-201 | ENST00000432430 | 273 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC009237.8-201 | ENST00000445492 | 379 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MCHR2-AS1-203 | ENST00000451220 | 429 nt | TSL 3 BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | LINC01038-201 | ENST00000457858 | 428 nt | TSL 3 BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
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| SEMA3A | Q14563 | AC021205.2-201 | ENST00000480069 | 347 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL160314.1-201 | ENST00000490836 | 438 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RBBP4P6-201 | ENST00000508098 | 202 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RN7SKP256-201 | ENST00000517201 | 314 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC091944.1-201 | ENST00000521984 | 449 nt | TSL 3 BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MTND4P7-201 | ENST00000523876 | 130 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | COPS8P3-201 | ENST00000526024 | 482 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AP000755.2-201 | ENST00000526777 | 571 nt | TSL 5 BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | LINC02350-201 | ENST00000544419 | 480 nt | TSL 3 BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | BNIP3P6-201 | ENST00000549284 | 499 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC099793.1-201 | ENST00000567538 | 285 nt | TSL 3 BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AP001496.1-201 | ENST00000579113 | 471 nt | TSL 4 BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MIR4424-201 | ENST00000585257 | 86 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC008521.1-201 | ENST00000587471 | 187 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL355802.3-201 | ENST00000607571 | 545 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC022893.3-201 | ENST00000607665 | 437 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL133215.3-201 | ENST00000609801 | 448 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC010205.1-201 | ENST00000616668 | 449 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | CNOT1-223 | ENST00000628857 | 291 nt | TSL 5 BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | ATF2-204 | ENST00000409437 | 3697 nt | TSL 5 BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AMY2B-208 | ENST00000610648 | 1736 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | KIAA0586-209 | ENST00000556134 | 5912 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | TTN-204 | ENST00000360870 | 18218 nt | TSL 5 BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | PLCZ1-209 | ENST00000539875 | 1398 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MBNL1-206 | ENST00000357472 | 5256 nt | TSL 5 BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | GABRG2-229 | ENST00000641017 | 3628 nt | BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RHOT1-204 | ENST00000394692 | 2960 nt | TSL 2 BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | CACNB4-222 | ENST00000636350 | 7654 nt | TSL 5 BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC093010.3-201 | ENST00000570269 | 15214 nt | BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | LRRTM2-201 | ENST00000274711 | 6017 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | DMD-203 | ENST00000357033 | 13956 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-254P-201 | ENST00000363377 | 107 nt | BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU4-66P-201 | ENST00000365199 | 138 nt | BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SNORA33.2-201 | ENST00000365413 | 134 nt | BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | Y_RNA.373-201 | ENST00000365600 | 103 nt | BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | CXorf65-201 | ENST00000374251 | 601 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-14P-201 | ENST00000384630 | 106 nt | BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-308P-201 | ENST00000390957 | 107 nt | BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RPS29P4-201 | ENST00000414733 | 161 nt | BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL356968.1-201 | ENST00000416622 | 474 nt | BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |