Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
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SEMA3AQ14563 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
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SEMA3AQ14563 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
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