Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SPIDRQ14159 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.8 ms