Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
SCARB2Q14108 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SCARB2Q14108 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
SCARB2Q14108 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SCARB2Q14108 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SCARB2Q14108 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
SCARB2Q14108 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SCARB2Q14108 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SCARB2Q14108 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SCARB2Q14108 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SCARB2Q14108 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SCARB2Q14108 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SCARB2Q14108 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SCARB2Q14108 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
SCARB2Q14108 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SCARB2Q14108 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SCARB2Q14108 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SCARB2Q14108 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SCARB2Q14108 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SCARB2Q14108 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SCARB2Q14108 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SCARB2Q14108 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SCARB2Q14108 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SCARB2Q14108 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SCARB2Q14108 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
SCARB2Q14108 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SCARB2Q14108 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
SCARB2Q14108 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCARB2Q14108 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCARB2Q14108 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCARB2Q14108 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SCARB2Q14108 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCARB2Q14108 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCARB2Q14108 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SCARB2Q14108 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCARB2Q14108 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SCARB2Q14108 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SCARB2Q14108 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCARB2Q14108 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SCARB2Q14108 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCARB2Q14108 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCARB2Q14108 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCARB2Q14108 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SCARB2Q14108 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCARB2Q14108 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SCARB2Q14108 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCARB2Q14108 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCARB2Q14108 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCARB2Q14108 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCARB2Q14108 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SCARB2Q14108 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SCARB2Q14108 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCARB2Q14108 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCARB2Q14108 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCARB2Q14108 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SCARB2Q14108 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SCARB2Q14108 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCARB2Q14108 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCARB2Q14108 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SCARB2Q14108 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SCARB2Q14108 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SCARB2Q14108 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SCARB2Q14108 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
SCARB2Q14108 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SCARB2Q14108 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SCARB2Q14108 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SCARB2Q14108 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SCARB2Q14108 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SCARB2Q14108 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SCARB2Q14108 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SCARB2Q14108 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SCARB2Q14108 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SCARB2Q14108 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SCARB2Q14108 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SCARB2Q14108 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SCARB2Q14108 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SCARB2Q14108 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SCARB2Q14108 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
SCARB2Q14108 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SCARB2Q14108 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
SCARB2Q14108 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SCARB2Q14108 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SCARB2Q14108 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SCARB2Q14108 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
SCARB2Q14108 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SCARB2Q14108 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SCARB2Q14108 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SCARB2Q14108 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SCARB2Q14108 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
SCARB2Q14108 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SCARB2Q14108 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SCARB2Q14108 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SCARB2Q14108 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SCARB2Q14108 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SCARB2Q14108 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SCARB2Q14108 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SCARB2Q14108 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SCARB2Q14108 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
SCARB2Q14108 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SCARB2Q14108 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
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