Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms