Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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