Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.46□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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