Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PEX6Q13608 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms