Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.14□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC1.12□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.4 ms