Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC3.75□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC3.75□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
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