Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms