Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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