Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
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