Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
IFT88Q13099 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
IFT88Q13099 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
IFT88Q13099 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
IFT88Q13099 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
IFT88Q13099 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
IFT88Q13099 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
IFT88Q13099 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
IFT88Q13099 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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IFT88Q13099 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
IFT88Q13099 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
IFT88Q13099 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
IFT88Q13099 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
IFT88Q13099 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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IFT88Q13099 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
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IFT88Q13099 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
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IFT88Q13099 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
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IFT88Q13099 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
IFT88Q13099 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
IFT88Q13099 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
IFT88Q13099 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
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IFT88Q13099 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
IFT88Q13099 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
IFT88Q13099 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
IFT88Q13099 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
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IFT88Q13099 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
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IFT88Q13099 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
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IFT88Q13099 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2□□□□□ -2.09
IFT88Q13099 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
IFT88Q13099 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
IFT88Q13099 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
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IFT88Q13099 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
IFT88Q13099 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
IFT88Q13099 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
IFT88Q13099 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
IFT88Q13099 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
IFT88Q13099 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
IFT88Q13099 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
IFT88Q13099 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
IFT88Q13099 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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